Abdullah Gül'ün Cumhurbaşkanı olmasıyla birlikte, bugüne kadar YÖK üyeliklerine iktidara yakın isimler atandı. Kurulun yapısı ve dengeler de değişti.

Sezer'in YÖK Başkanlığı'na getirdiği Prof. Dr. Erdoğan Teziç'in yerine İslami çalışmalarıyla dikkat çeken Prof. Dr. Yusuf Ziya Özcan'ın atanması ile birlikte, Sezer'in atadığı üyelerden önce Aybar Ertepınar sonra da Bülent Serim istifa etti.

Yasaya göre YÖK üyeliklerine, Cumhurbaşkanı'nca 7, Bakanlar Kurulu'nca 7, Üniversiteler Arası Kurul tarafından da 7 isim atanıyor ve toplam 21 kişiden oluşuyor. Bakanlar Kurulu'nca belirlenen isimlerin çoğu hükümete yakınlığıyla biliniyor. Üyeler 4 yıl görev yapıyor. Serim'in istifası sonrası YÖK'te, Sezer'in atadığı isimlerden sadece Prof. Ali Ekrem Özkul kaldı. YÖK'ün yapısı Gül ve AK PARTİ hükümeti döneminde atanan isimler ile değiştirildi.

BAŞKAN MALEZYA EKOLÜNDEN

Başkanlığa Aralık 2007'de Yusuf Ziya Özcan atandı.. ODTÜ Sosyoloji Bölümü öğretim üyesi olan Özcan'ın İslami konuları işleyen makaleleri dikkat çekti. Malezya'daki Uluslararası İslam Üniversitesi'nde öğretim görevlisi olarak çalıştı. AK PARTİ içinde çeşitli araştırmalar yapan şirket Pollmark'ın kurucularından olan Özcan, bir makalesinde, "İslami kurallara göre yaşansaydı az problem olurdu" dedi. Özcan'ınm görevi Aralık 2011'de bitecek.

Habername